Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HRCP23327 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HRCP23327 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HRCP23327 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HRCP23327 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HRCP23327 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HRCP23327 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HRCP23327 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HRCP23327 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HRCP23327 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms