Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1P21675 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1P21675 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1P21675 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1P21675 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms