Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT1P21579 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT1P21579 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT1P21579 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT1P21579 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT1P21579 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT1P21579 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT1P21579 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT1P21579 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT1P21579 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT1P21579 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT1P21579 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT1P21579 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT1P21579 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT1P21579 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYT1P21579 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms