Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CD247P20963 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CD247P20963 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD247P20963 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD247P20963 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms