Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTPS1P17812 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms