Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAV1P15498 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAV1P15498 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VAV1P15498 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms