Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms