Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI3P10071 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLI3P10071 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLI3P10071 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLI3P10071 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLI3P10071 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI3P10071 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI3P10071 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms