Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L5P0DN76 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms