Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB1P08238 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB1P08238 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms