Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSMBP08118 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms