Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA4P06727 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA4P06727 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA4P06727 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA4P06727 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA4P06727 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA4P06727 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA4P06727 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA4P06727 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA4P06727 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA4P06727 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA4P06727 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA4P06727 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA4P06727 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA4P06727 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA4P06727 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms