Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A1P02462 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A1P02462 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms