Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN7O95471 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms