Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETM1O95202 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETM1O95202 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETM1O95202 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETM1O95202 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms