Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms