Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms