Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPAG9O60271 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
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