Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX5O60225 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX5O60225 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX5O60225 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX5O60225 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms