Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT7O43581 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT7O43581 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT7O43581 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT7O43581 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT7O43581 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms