Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AGRNO00468 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms