Protein–RNA interactions for Protein: O00110

OVOL3, Putative transcription factor ovo-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OVOL3O00110 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OVOL3O00110 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OVOL3O00110 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms