Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms