Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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USP27XA6NNY8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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USP27XA6NNY8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP27XA6NNY8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP27XA6NNY8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP27XA6NNY8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP27XA6NNY8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP27XA6NNY8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP27XA6NNY8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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