Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms