Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ISPDA4D126 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ISPDA4D126 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms