Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms