Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms