Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHOC2Q9UQ13 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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