Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms