Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms