Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms