Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms