Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms