Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP2Q9UDT6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms