Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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