Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SH3BP4Q9P0V3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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