Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSRB1Q9NZV6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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