Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms