Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GDAP2Q9NXN4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms