Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms