Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms