Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTG1Q9NSN8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms