Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms