Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSHZ2Q9NRE2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms