Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms