Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP4Q9C0A0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms