Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms