Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms