Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms